Głównym celem działania instytutu jest wzmacnianie współpracy gospodarczej, naukowej, kulturalnej i politycznej infrastrukturalnej w regionie Europy Środkowo-Wschodniej. Naszym dążeniem jest:

1. Strategiczne partnerstwo z USA.
2. Utworzenie stałych struktur Międzymorza.
3. Sekretariat jako stały organ dla koordynacji i lobbyingu projektów.
4. Wspólne przedstawicielstwo krajów Trójmorza w UE i w Waszyngtonie.
5. Rozwój infrastruktury transportowej – rozwój połączeń drogowych (Via Carpatia), kolejowych (Rail Baltica), morskich (integracja portów morskich: współpraca między portami w Gdańsku, Kłajpedzie, Rijece i Konstancy i Salonikach) oraz powietrznych (Centralny Port Komunikacyjny). Rozwój centrów logistycznych intermodalnych takich jak Małaszewicze.
6. Energetyka – zwiększenie bezpieczeństwa energetycznego poprzez projekty takie jak: gazociągi oraz dywersyfikacja źródeł energii. Wspólny rynek energii: harmonizacja regulacji energetycznych, by ułatwić handel energią w regionie. Rozwój energetyki jądrowej.
7. Cyfryzacja – rozbudowa infrastruktury telekomunikacyjnej, w tym sieci 5G i wspólnych projektów cyfrowych.
8. Zwiększenie finansowania dla projektu Międzymorza i zaangażowanie inwestorów w ten obszar Europy.
9. Zachęty dla sektora prywatnego: ulgi podatkowe i gwarancje rządowe dla firm inwestujących w projekty rozwijające współpracę w obszarze Międzymorza.
10. Poszerzenie Inicjatywy o kraje Skandynawii – Szwecja, Norwegia, Finlandia.
11. Współpraca z innymi krajami regionu – np. Turcja.
12. Marka Międzymorza, promocja, kampania informacyjna i edukacyjna, wspólne inicjatywy kulturalne.
13. Forum biznesowe: coroczne spotkanie przedsiębiorców z regionu, by łączyć firmy i promować wspólne inwestycje.
14. Programy wymiany studentów budujące poczucie wspólnoty w nowym pokoleniu.